RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 ITGA10O75578 1167 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PPP2R1BP30154 601 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RFC3P40938 356 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 KIR3DL1P43629 444 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SLC6A12P48065 614 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 MEOX1P50221 254 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CLCN2P51788 898 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ARL4CP56559 192 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RUNX2Q13950 521 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TGFBIQ15582 683 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 MDGA2Q7Z553 956 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SULF2Q8IWU5 870 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM156Q8N614 296 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TTLQ8NG68 377 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CCT6BQ92526 530 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 VPS39Q96JC1 886 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FAR2Q96K12 515 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RHOJQ9H4E5 214 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PPT2Q9UMR5 302 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NF1P21359 2839 aa9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 E7ESA3 106 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 B3GALT2O43825 422 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PEX1O43933 1283 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 HS6ST1O60243 411 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CLEC3AO75596 197 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PIAS1O75925 651 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TFEBP19484 476 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 GSTM2P28161 218 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PTGS2P35354 604 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 GPR143P51810 404 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 HSD17B7P56937 341 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RAB38P57729 211 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 GPR85P60893 370 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SLC13A2Q13183 592 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CD163Q86VB7 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FAM47BQ8NA70 645 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 OR2L5Q8NG80 312 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NCLNQ969V3 563 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 VMP1Q96GC9 406 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 QRFPRQ96P65 431 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 KRT12Q99456 494 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 DERL2Q9GZP9 239 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FREM3P0C091 2139 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 NINQ8N4C6 2090 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 A0A088AWK7 358 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1B0GTH9 108 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 FAM187AA6NFU0 413 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CLDN4O14493 209 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TAPBPO15533 448 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PRAMEF4O60810 478 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 TPOP07202 933 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CERS1P27544 350 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SSTR2P30874 369 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 CASQ1P31415 396 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 SSR4P51571 173 aa9.49□□□□□ -0.89
MFGE8-216ENST00000613965 PLA2G16P53816 162 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms