RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 MASP2O00187 686 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PFDN6O15212 129 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD1O60671 282 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFS1P28331 727 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC12A2P55011 1212 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MANEAQ5SRI9 462 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ADCK2Q7Z695 626 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CALML6Q8TD86 181 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB9Q96DX5 294 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MED8Q96G25 268 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TAC3Q9UHF0 121 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RARRES3Q9UL19 164 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FER1L5A0AVI2 2057 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YVX5 310 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS26AO75436 327 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SCRG1O75711 98 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 LIPCP11150 499 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ALAS2P22557 587 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PKLRP30613 574 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SHMT2P34897 504 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ERV3-1Q14264 604 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 EXT2Q93063 718 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ESAMQ96AP7 390 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FOPNLQ96NB1 174 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PCM1Q15154 2024 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RTCAO00442 366 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NPHS1O60500 1241 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 AGKQ53H12 422 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC23LQ6PF05 361 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DTX1Q86Y01 620 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNJ9Q92806 393 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PHF21BQ96EK2 531 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS7Q9Y394 339 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C7orf72A4D263 438 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BMM5 538 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC7O00311 574 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSVO60911 334 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A5P33763 92 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 IGSF11Q5DX21 431 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 REP15Q6BDI9 236 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF480Q8WV37 535 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE7BQ9NP56 450 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 VWA7Q9Y334 891 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 AP4S1Q9Y587 144 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FLNCQ14315 2725 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM247A6NEH6 219 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 B4E171 279 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FBP2O00757 339 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 UBDO15205 165 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6AP2O75787 350 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MATN4O95460 622 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms