RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 PLAAQ9Y263 795 aa25.33■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 SPACA6W5XKT8 324 aa25.33■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 A8MUI8 341 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 FAM227AF5H4B4 570 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SH3BGRLO75368 114 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CELA2AP08217 269 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 GCAP28676 217 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TNFRSF8P28908 595 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 RAP1GDS1P52306 607 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 RUNX2Q13950 521 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 Q6ZS92 163 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 LCA5Q86VQ0 697 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MIB2Q96AX9 1013 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 KCNK13Q9HB14 408 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MMACHCQ9Y4U1 282 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 DOCK10Q96BY6 2186 aa25.32■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 E2F3O00716 465 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CLDN9O95484 217 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MYBL2P10244 700 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CERS1P27544 350 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 PIK3CBP42338 1070 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 BTG2P78543 158 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TLR1Q15399 786 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 Q8NA96 180 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 M1APQ8TC57 530 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 QRFPRQ96P65 431 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SLC29A3Q9BZD2 475 aa25.31■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ABI3Q9P2A4 366 aa25.31■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MAOAP21397 527 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SSR2P43308 183 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TAS2R50P59544 299 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ZNF33BQ06732 778 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SLC13A2Q13183 592 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 FAM47BQ8NA70 645 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 PSMF1Q92530 271 aa25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 PPCSQ9HAB8 311 aa25.3■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SOX11P35716 441 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 HSD17B7P56937 341 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ZNF595Q8IYB9 648 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 RGMAQ96B86 450 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.643e-7■■■□□ 19.1
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BRD4-208ENST00000597315 DAPP1Q9UN19 280 aa25.29■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.29■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 H0YIV9 168 aa25.28■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 SAP18O00422 153 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 LIM2P55344 173 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 DEPDC1Q5TB30 811 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CUZD1Q86UP6 607 aa25.28■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SUN3Q8TAQ9 357 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MMP25Q9NPA2 562 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 STMN3Q9NZ72 180 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 PCTPQ9UKL6 214 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.27■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 KRT15P19012 456 aa25.27■■□□□ 1.64
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BRD4-208ENST00000597315 SLC26A5P58743 744 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SLC5A8Q8N695 610 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 ACOT4Q8N9L9 421 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 OR1N1Q8NGS0 311 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 LYRM4Q9HD34 91 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 PLA2G3Q9NZ20 509 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 SCN2AQ99250 2005 aa25.27■■□□□ 1.64
BRD4-208ENST00000597315 MYO18BQ8IUG5 2567 aa25.26■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 SMIM23A6NLE4 172 aa25.26■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 A8MT66 165 aa25.26■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 GSTA1P08263 222 aa25.26■■□□□ 1.63
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