RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 SHBGP04278 402 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MAOAP21397 527 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 LIM2P55344 173 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 OR4D2P58180 307 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TGM3Q08188 693 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 EXT1Q16394 746 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CNPY4Q8N129 248 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF175Q8N4F7 328 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 M1APQ8TC57 530 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 LPAR4Q99677 370 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CLMPQ9H6B4 373 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 KCMF1Q9P0J7 381 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 DAPP1Q9UN19 280 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MMACHCQ9Y4U1 282 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CLDN16Q9Y5I7 305 aa18.67■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 A8MT66 165 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CYR61O00622 381 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC26A5P58743 744 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 DEPDC1Q5TB30 811 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CHSY3Q70JA7 882 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 IQCKQ8N0W5 287 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC77Q9BR77 488 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 NTMT1Q9BV86 223 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ROGDIQ9GZN7 287 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 OR51B5Q9H339 312 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MMP25Q9NPA2 562 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TBK1Q9UHD2 729 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SHANK1Q9Y566 2161 aa18.66■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SH3BGRLO75368 114 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CLDN9O95484 217 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 HSD17B7P56937 341 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 TRAF3Q13114 568 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM47BQ8NA70 645 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 HAS2Q92819 552 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 REPS1Q96D71 796 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CDK15Q96Q40 435 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 CSF3RQ99062 836 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF32Q9H0A6 362 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 LYRM4Q9HD34 91 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.65■□□□□ 0.58
EFTUD2-217ENST00000590124 GOLGA8RI6L899 631 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 ARFIP1P53367 373 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 TLR1Q15399 786 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 TDRPQ86YL5 185 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF595Q8IYB9 648 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 ELP5Q8TE02 316 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 C19orf60Q96EN9 201 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 PPCSQ9HAB8 311 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1B0GTL3 188 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PPM1 405 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.63■□□□□ 0.57
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms