RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PTGR1Q14914 329 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GKN2Q86XP6 184 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A45Q8N413 288 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LRRC58Q96CX6 371 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 COQ8BQ96D53 544 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MTERF3Q96E29 417 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 THAP11Q96EK4 314 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 APOLD1Q96LR9 279 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 QRFPRQ96P65 431 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NRTNQ99748 197 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 WDR70Q9NW82 654 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MCM8Q9UJA3 840 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GMEB1Q9Y692 573 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NF1P21359 2839 aa11.38□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR2A25A4D2G3 310 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LMO7DNF2Z398 122 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 BTN3A3O00478 584 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SCAMP1O15126 338 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TBX19O60806 448 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ATP6V1G2O95670 118 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PGRP06401 933 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ME2P23368 584 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A2P23975 617 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TACR1P25103 407 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 NME5P56597 212 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PWP1Q13610 501 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CEACAM7Q14002 265 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GPR18Q14330 331 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZNF787Q6DD87 383 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 AAGABQ6PD74 315 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 IKBIPQ70UQ0 350 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PAQR7Q86WK9 346 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 RNF175Q8N4F7 328 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRPV3Q8NET8 790 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GTF2H4Q92759 462 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 OR2A14Q96R47 310 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ABCG4Q9H172 646 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 POMPQ9Y244 141 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 C2orf74A8MZ97 194 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 YY2O15391 372 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 DNAJA2O60884 412 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SCN2BO60939 215 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 SDC3O75056 442 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 KLHL18O94889 574 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TNFSF15O95150 251 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TGFB1P01137 390 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 CKMT1AP12532 417 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 HSD17B1P14061 328 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 PSMB5P28074 263 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 GRIA3P42263 894 aa11.36□□□□□ -0.59
GGA3-217ENST00000583667 TRPC1P48995 793 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms