RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	PLA2G16	P53816	162 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MTTP	P55157	894 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CAV1	Q03135	178 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	STX4	Q12846	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HYAL2	Q12891	473 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF460	Q14592	562 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PDK4	Q16654	411 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PAOX	Q6QHF9	649 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CYS1	Q717R9	158 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CEP97	Q8IW35	865 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NPAS2	Q99743	824 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ERP44	Q9BS26	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HES7	Q9BYE0	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TINAG	Q9UJW2	476 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RNF112	Q9ULX5	631 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	DYRK3	O43781	588 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MAN1A2	O60476	641 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	DNAJB6	O75190	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CLDN14	O95500	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TNNI3	P19429	210 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GGT5	P36269	586 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	KCNC1	P48547	511 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SSR4	P51571	173 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	IRF8	Q02556	426 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CBLB	Q13191	982 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RAPH1	Q70E73	1250 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CHSY3	Q70JA7	882 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SHISA5	Q8N114	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	KCNC2	Q96PR1	638 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MEMO1	Q9Y316	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	USP27X	A6NNY8	438 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743		A8MVJ9	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743		E9PLN8	166 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PEX1	O43933	1283 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CTNS	O60931	367 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ITGA10	O75578	1167 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TUBB4A	P04350	444 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	COX7A2	P14406	83 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SERPINB1	P30740	379 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SSTR1	P30872	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HSPA7	P48741	367 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	MEOX1	P50221	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RAB10	P61026	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SERTAD2	Q14140	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GRTP1	Q5TC63	336 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HSDL2	Q6YN16	418 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	AMER2	Q8N7J2	671 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	GPR22	Q99680	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RBBP8	Q99708	897 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	DPH5	Q9H2P9	285 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	HPF1	Q9NWY4	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0G2JN53	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	ACOT7	O00154	380 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-208	ENST00000579743	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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