RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566583.5

SNHG20-204, Transcript of small nucleolar RNA host gene 20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG20, Length 1,338 nt, Biotype sense overlapping, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG20-204ENST00000566583 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 E9PBE3 544 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 SGK494L7N484 410 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 PCDH7O60245 1069 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 KLHL41O60662 606 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 DLGAP3O95886 979 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 GBAP04062 536 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 HBQ1P09105 142 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 PRPS2P11908 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 CBX1P83916 185 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NXNQ6DKJ4 435 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 COX15Q7KZN9 410 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 CA13Q8N1Q1 262 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 EGLN2Q96KS0 407 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 EBPLQ9BY08 206 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 MYNNQ9NPC7 610 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 DAPP1Q9UN19 280 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 A0A088AWK7 358 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 UBDO15205 165 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 B3GALT2O43825 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 RDH16O75452 317 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 KIAA0754O94854 1291 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NTRK1P04629 796 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 G6PDP11413 515 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 MAPK1P28482 360 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 GSTM5P46439 218 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 LIM2P55344 173 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 C21orf58P58505 322 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 SLAMF1Q13291 335 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 RTP5Q14D33 572 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 DSELQ8IZU8 1212 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 LIX1Q8N485 282 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 LYRM4Q9HD34 91 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG20-204ENST00000566583 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 A0A1W2PR48 441 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 CYR61O00622 381 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 PROM1O43490 865 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 CHST10O43529 356 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 MYO1DO94832 1006 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 TNFSF15O95150 251 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 PCSK2P16519 638 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 OR1D4P47884 311 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 AVPR1BP47901 424 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 ATP4BP51164 291 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 GABREP78334 506 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 OLR1P78380 273 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 DSG2Q14126 1118 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 SLC9A5Q14940 896 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 GSTA3Q16772 222 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 LCN10Q6JVE6 187 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 RNF31Q96EP0 1072 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 MARK4Q96L34 752 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG20-204ENST00000566583 RILPQ96NA2 401 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms