RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 A6NCN8 305 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 DOK2O60496 412 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 LRCH4O75427 683 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CSH1P0DML2 217 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CSH2P0DML3 217 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 ERVK-16P61578 105 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 DLK1P80370 383 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CHAF1BQ13112 559 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CUL3Q13618 768 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 ZNF146Q15072 292 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 FHL5Q5TD97 284 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 C4orf50Q6ZRC1 276 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 RAPH1Q70E73 1250 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.51□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 ADNPQ9H2P0 1102 aa2.51□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 GDE1Q9NZC3 331 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 B4GALT7Q9UBV7 327 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.51□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 DNHD1Q96M86 4753 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 SH3TC1Q8TE82 1336 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 GLOD5A6NK44 160 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 YDJCA8MPS7 323 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 SAGP10523 405 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.5□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 SPATA18Q8TC71 538 aa2.5□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 ITPR3Q14573 2671 aa2.49□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.49□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RRN3-204ENST00000561685 BADQ92934 168 aa2.49□□□□□ -2.01
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RRN3-204ENST00000561685 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.49□□□□□ -2.01
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