RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 MESDQ14696 234 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TGFBIQ15582 683 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 VAMP3Q15836 100 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CAMK4Q16566 473 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RABL3Q5HYI8 236 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR157Q5UAW9 335 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AGAP6Q5VW22 663 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CBLN3Q6UW01 205 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CENPUQ71F23 418 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRGPREQ86SM8 312 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SFR1Q86XK3 245 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PLD3Q8IV08 490 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LAX1Q8IWV1 398 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NELFCDQ8IXH7 590 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 THEM5Q8N1Q8 247 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SCAIQ8N9R8 606 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RDM1Q8NG50 284 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RAET1EQ8TD07 263 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TCP11Q8WWU5 503 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ING5Q8WYH8 240 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGBQ92521 554 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HAS1Q92839 578 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC38A4Q969I6 547 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 RFT1Q96AA3 541 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SPDL1Q96EA4 605 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 COQ2Q96H96 371 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MED30Q96HR3 178 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 DUX5Q96PT3 197 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAM2Q99965 735 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 IFT27Q9BW83 186 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NTN4Q9HB63 628 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C8orf4Q9NR00 106 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR173Q9NS66 373 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MED17Q9NVC6 651 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 UPB1Q9UBR1 384 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 AMFRQ9UKV5 643 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.35□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 C1orf226A1L170 272 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 MGAT4DA6NG13 374 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 E7ENX8 843 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 E7ESA3 106 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA8RI6L899 631 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 WWP2O00308 870 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 FBP2O00757 339 aa3.34□□□□□ -1.87
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGB1BP1O14713 200 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms