RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 KCNC2Q96PR1 638 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 LPAR4Q99677 370 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 NPAS2Q99743 824 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RNF32Q9H0A6 362 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MMP25Q9NPA2 562 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 FETUBQ9UGM5 382 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TGFBR3LH3BV60 316 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 STX16O14662 325 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 UGDHO60701 494 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 VPS4BO75351 444 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SCELO95171 688 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 GNLYP22749 145 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PIK3CGP48736 1102 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 LIM2P55344 173 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ARG2P78540 354 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TLR1Q15399 786 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TEX35Q5T0J7 233 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 LIPJQ5W064 366 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TIFABQ6ZNK6 161 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 FAM47BQ8NA70 645 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 HUS1BQ8NHY5 278 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 HAS2Q92819 552 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MTBPQ96DY7 904 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PHF21BQ96EK2 531 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SCYL1Q96KG9 808 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CSF3RQ99062 836 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 IPPKQ9H8X2 491 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ACTR8Q9H981 624 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PCTPQ9UKL6 214 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TMCO1Q9UM00 188 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 DAPP1Q9UN19 280 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 VPS4AQ9UN37 437 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 H0YIV9 168 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RTCAO00442 366 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CYR61O00622 381 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 OR7A17O14581 309 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SH3BGRLO75368 114 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 WDPCPO95876 746 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 F10P00742 488 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TGFB1P01137 390 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 UQCRHP07919 91 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TNFRSF8P28908 595 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TNFSF10P50591 281 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZNF33BQ06732 778 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TGM3Q08188 693 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 FCRLBQ6BAA4 426 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ELP5Q8TE02 316 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MZB1Q8WU39 189 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 OR51B5Q9H339 312 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 KCNK13Q9HB14 408 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MAP10Q9P2G4 905 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 DYTNA2CJ06 578 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MAN1A2O60476 641 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SMIM24O75264 130 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 PIK3CBP42338 1070 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 HSD17B7P56937 341 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 LGSNQ5TDP6 509 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ZNF595Q8IYB9 648 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 CYP4X1Q8N118 509 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-219ENST00000550655 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms