RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM202	A6NGA9	273 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MMP20	O60882	483 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CLEC3A	O75596	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	C9	P02748	559 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	EPHX1	P07099	455 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	FURIN	P09958	794 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	LAMP1	P11279	417 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	JUND	P17535	347 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	UQCRC2	P22695	453 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CRHBP	P24387	322 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PDHA2	P29803	388 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	GJA4	P35212	333 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	GRK3	P35626	688 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	VIPR2	P41587	438 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PRIM2	P49643	509 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CLCNKA	P51800	687 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SMIM11A	P58511	58 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CDK3	Q00526	305 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SGCG	Q13326	291 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	NR4A3	Q92570	626 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	DNASE1L2	Q92874	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	INPP5K	Q9BT40	448 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CHST8	Q9H2A9	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PIF1	Q9H611	641 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR26	Q9H7D7	661 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MPZL2	O60487	215 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	DDC	P20711	480 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	IGFBP5	P24593	272 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	OPRD1	P41143	372 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	BDKRB1	P46663	353 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC6A11	P48066	632 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	HMGA2	P52926	109 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ISL1	P61371	349 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	TGM3	Q08188	693 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	C2orf80	Q0P641	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	STARD3	Q14849	445 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CST6	Q15828	149 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	RGMA	Q96B86	450 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LETMD1-223	ENST00000550442	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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