RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.28	□□□□□ -0.6
DDB1-223	ENST00000543658	C4orf51	C9J302	202 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658		H3BMH7	237 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SGK494	L7N484	410 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC22	O60826	627 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RDH16	O75452	317 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TNFSF15	O95150	251 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TIAF1	O95411	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	GBA	P04062	536 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	NTRK1	P04629	796 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PRR35	P0CG20	571 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CPN2	P22792	545 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ID4	P47928	161 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	STARD8	Q92502	1023 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM10	Q96HG1	83 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MARK4	Q96L34	752 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	KNTC1	P50748	2209 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0A6YYD5	115 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658		C9J4A7	227 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	FOXS1	O43638	330 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DCTN3	O75935	186 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	STK17B	O94768	372 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SCEL	O95171	688 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	B3GALT4	O96024	378 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	BCKDHA	P12694	445 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SDC1	P18827	310 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	HPCAL1	P37235	193 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RAB38	P57729	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R50	P59544	299 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	OLR1	P78380	273 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	SQLE	Q14534	574 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM198	Q66K66	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	GPR180	Q86V85	440 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MIER2	Q8N344	545 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DPY30	Q9C005	99 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MYNN	Q9NPC7	610 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DDB1-223	ENST00000543658	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.26	□□□□□ -0.61

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