RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542113.1

NKRF-204, Transcript of NFKB repressing factor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NKRF, Length 3,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRF-204ENST00000542113 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 HTRA1Q92743 480 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 QRFPRQ96P65 431 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PKP4Q99569 1192 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MGLLQ99685 303 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CTRCQ99895 268 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 A0A1W2PRB8 838 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TRBC2A0A5B9 178 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 IRGMA1A4Y4 181 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ZAR1LA6NP61 321 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 YY2O15391 372 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ZW10O43264 779 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PI15O43692 258 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PTHP01270 115 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 INHAP05111 366 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 HSMCR30P0CW71 290 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 BDKRB1P46663 353 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MVDP53602 400 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CRYBA2P53672 197 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TBPL1P62380 186 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ZXDBP98169 803 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CNTN1Q12860 1018 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MED22Q15528 200 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 NDUFA9Q16795 377 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 BCL7AQ4VC05 210 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RNF130Q86XS8 419 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 METTL4Q8N3J2 472 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RNF175Q8N4F7 328 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 26.8
NKRF-204ENST00000542113 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 UBE2FQ969M7 185 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 OR4K3Q96R72 315 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ASAH2Q9NR71 780 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ICKQ9UPZ9 632 aa6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PIPSLA2A3N6 862 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 FAAHO00519 579 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TBX19O60806 448 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MTX2O75431 263 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SLITRK5O94991 958 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SEMA3DO95025 777 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ETHE1O95571 254 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 OPN1SWP03999 348 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CXCR2P25025 360 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SLC15A1P46059 708 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 LIMS1P48059 325 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 NUDT6P53370 316 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SLC13A2Q13183 592 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 KCNJ8Q15842 424 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 RNLSQ5VYX0 342 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CASP12Q6UXS9 341 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 Q6ZVL8 140 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 OR52J3Q8NH60 311 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SCAMP4Q969E2 229 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 NEIL2Q969S2 332 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 MND1Q9BWT6 205 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SGPP1Q9BX95 441 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 ACER3Q9NUN7 267 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 EHD3Q9NZN3 535 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 KCND3Q9UK17 655 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 SNTNA6NMZ2 147 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.49□□□□□ -1.37
NKRF-204ENST00000542113 TLR4O00206 839 aa6.49□□□□□ -1.37
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