RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 UNC5CO95185 931 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PCNAP12004 261 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TYK2P29597 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PHBP35232 272 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MSH2P43246 934 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CYB561P49447 251 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TDGF1P3P51864 188 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PMP22Q01453 160 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 RBPJQ06330 500 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NAB1Q13506 487 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 RCN2Q14257 317 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PDPRQ8NCN5 879 aa8.44□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 OR2L5Q8NG80 312 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ELP5Q8TE02 316 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 UBE2E3Q969T4 207 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NXNL1Q96CM4 212 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 F2RL3Q96RI0 385 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SERINC2Q96SA4 455 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NPAS2Q99743 824 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 AICDAQ9GZX7 198 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 EHD1Q9H4M9 534 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 OPTCQ9UBM4 332 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LRBAP50851 2863 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NINQ8N4C6 2090 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 AKAP9Q99996 3911 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 A0A087X1B8 175 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 SYCE1LA8MT33 242 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 C4orf51C9J302 202 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF4O60810 478 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MLYCDO95822 493 aa8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 SP1P08047 785 aa8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 STX4Q12846 297 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 DLG1Q12959 904 aa8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MED27Q6P2C8 311 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KLC3Q6P597 504 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CHSY3Q70JA7 882 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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LMO3-222ENST00000540445 TMEM156Q8N614 296 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 FAM47BQ8NA70 645 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MDS2Q8NDY4 140 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 IFT81Q8WYA0 676 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KCNC2Q96PR1 638 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CCDC77Q9BR77 488 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 HES7Q9BYE0 225 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 COPG2Q9UBF2 871 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 DAPP1Q9UN19 280 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.43□□□□□ -1.06
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