RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527225.1

SPCS2-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPCS2, Length 321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2-204ENST00000527225 ABI3Q9P2A4 366 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 BLACEA4D250 179 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SEMA7AO75326 666 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 GFAPP14136 432 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 EDN3P14138 238 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 MSH2P43246 934 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SERPINB9P50453 376 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 MTTPP55157 894 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SETDB1Q15047 1291 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 MED27Q6P2C8 311 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 LAS2Q8IYD9 372 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 BEST3Q8N1M1 668 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SLC5A8Q8N695 610 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 CEP112Q8N8E3 955 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ELP5Q8TE02 316 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 MS4A8Q9BY19 250 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 VPS11Q9H270 941 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 E2F3O00716 465 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 CLDN4O14493 209 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 KLK8O60259 260 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PRAMEF2O60811 474 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 CERS1P27544 350 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SERPINB1P30740 379 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 HSD17B7P56937 341 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 RCN2Q14257 317 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PFKFB4Q16877 469 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 LGI4Q8N135 537 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 TEX9Q8N6V9 391 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ISL2Q96A47 359 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 GPR78Q96P69 363 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 KCNC2Q96PR1 638 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 F2RL3Q96RI0 385 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PAFAH2Q99487 392 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 NPAS2Q99743 824 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 OLAHQ9NV23 265 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS2-204ENST00000527225 CDK2AP1O14519 115 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 KRT38O76015 456 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 DDAH2O95865 285 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 PCNAP12004 261 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 MAGEA12P43365 314 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 LIM2P55344 173 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TUBA3CQ13748 450 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF595Q8IYB9 648 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 OR7G3Q8NG95 312 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TAAR6Q96RI8 345 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 DAPP1Q9UN19 280 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 A8MUA0 341 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 CYR61O00622 381 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 RASAL1O95294 804 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 RBP1P09455 135 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 GP1BBP13224 206 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 CNTFP26441 200 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 SLC13A2Q13183 592 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TERF2Q15554 542 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 ZNF766Q5HY98 468 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TECRLQ5HYJ1 363 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 LIPJQ5W064 366 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 CHSY3Q70JA7 882 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 KIF2BQ8N4N8 673 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 FAM47BQ8NA70 645 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 TMEM52Q8NDY8 209 aa16■□□□□ 0.15
SPCS2-204ENST00000527225 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms