RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 MC1RQ01726 317 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXC1Q12948 553 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM53BQ14153 422 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 LCN10Q6JVE6 187 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 OGFOD2Q6N063 350 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX37Q96LM6 180 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMCX1Q9P291 453 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM227AF5H4B4 570 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO1DO94832 1006 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ERV3-1Q14264 604 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf78Q8WTQ4 265 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 FCRL1Q96LA6 429 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 TAAR9Q96RI9 348 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ENAMQ9NRM1 1142 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1B0GX78 115 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2W5A6NFC9 320 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GLOD5A6NK44 160 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GALT2O43825 422 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM58BPP0C7Q3 252 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GABREP78334 506 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM180BQ6P0A1 224 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PAGE2Q7Z2X7 111 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 OR9I1Q8NGQ6 314 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SERINC2Q96SA4 455 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CSF3RQ99062 836 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 AIG1Q9NVV5 245 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MCM8Q9UJA3 840 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TMED5Q9Y3A6 229 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.51■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DSCR3O14972 297 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSFP54793 590 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 LIM2P55344 173 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 UFM1P61960 85 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 C18orf63Q68DL7 685 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PAOXQ6QHF9 649 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 HOMEZQ8IX15 550 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM47BQ8NA70 645 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 COL26A1Q96A83 441 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TM4SF18Q96CE8 201 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GBP5Q96PP8 586 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTL8Q9H568 366 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A11Q9NSA0 550 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 C5AR2Q9P296 337 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ASB4Q9Y574 426 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PR48 441 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CHST10O43529 356 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 JRKO75564 520 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 IL3P08700 152 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 AVPR1BP47901 424 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CA13Q8N1Q1 262 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX11GQ96HA9 241 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM29Q9UKF5 820 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 KLK13Q9UKR3 277 aa21.5■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 EMP3P54852 163 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB15P59190 212 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SHC2P98077 582 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS6KA2Q15349 733 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SAR1AQ9NR31 198 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FCHO1O14526 889 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 STK17BO94768 372 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms