RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PHOX2B	Q99453	314 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PHF11	Q9UIL8	331 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	WASH4P	A8MWX3	477 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KCNC3	Q14003	757 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MORN1	Q5T089	497 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NAGS	Q8N159	534 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NATD1	Q8N6N6	113 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPR26	Q8NDV2	337 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf34	Q96MH7	638 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		A0A075B6Q4	140 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DRGX	A6NNA5	263 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		E7EQ34	232 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0513	O60268	411 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RFPL2	O75678	378 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLITRK5	O94991	958 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ATE1	O95260	518 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DPB1	P04440	258 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MPC1L	P0DKB6	136 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	IFI30	P13284	250 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SDC1	P18827	310 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RBBP4	Q09028	425 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SELPLG	Q14242	412 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf99	Q6UX52	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SPART	Q8N0X7	666 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PIP5K1A	Q99755	562 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BEX2	Q9BXY8	128 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C5AR2	Q9P296	337 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	WDR45	Q9Y484	360 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LRP5	O75197	1615 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		J3QLW9	94 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ACOT8	O14734	319 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM12	O43184	909 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJB5	O75953	348 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RET	P07949	1114 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CYBA	P13498	195 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF19	P17023	458 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CD9	P21926	228 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	STAR	P49675	285 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CRISP1	P54107	249 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GMFB	P60983	142 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FADD	Q13158	208 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA3B	Q13214	749 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SPHAR	Q15513	63 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RPTN	Q6XPR3	784 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LINGO2	Q7L985	606 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RNF175	Q8N4F7	328 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DOK4	Q8TEW6	326 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TRIB3	Q96RU7	358 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MCHR1	Q99705	422 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KCNK12	Q9HB15	430 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DIABLO	Q9NR28	239 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	INSL6	Q9Y581	213 aa		7.74	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SRC	P12931	536 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AHCY	P23526	432 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GADD45A	P24522	165 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PGBD5	Q8N414	524 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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