RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ULK1O75385 1050 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 SEMA5AQ13591 1074 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PCID2Q5JVF3 399 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LRRC66Q68CR7 880 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 P3H2Q8IVL5 708 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 S1PR5Q9H228 398 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 OR51B5Q9H339 312 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 METTL15A6NJ78 407 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 OR2AG2A6NM03 316 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 BTN3A3O00478 584 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TPP1O14773 563 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 LATS1O95835 1130 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DPA1P20036 260 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GPR1P46091 355 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 AP1S1P61966 158 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 BNC1Q01954 994 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 RGS1Q08116 209 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GRIK2Q13002 908 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 HTR4Q13639 388 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 KRT33BQ14525 404 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 NCF4Q15080 339 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.95□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 LUZP2Q86TE4 346 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GPAT4Q86UL3 456 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 NLRP8Q86W28 1048 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 KDM1BQ8NB78 822 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TSPEARQ8WU66 669 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PTP4A1Q93096 173 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CERS2Q96G23 380 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MMP27Q9H306 513 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 H0YAE9 185 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LDLRAD4O15165 306 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GMDSO60547 372 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 DNAJB6O75190 326 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PRAMEF1O95521 474 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 EPOP01588 193 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.94□□□□□ -1.3
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ROBO1-211ENST00000498428 SOX6P35712 828 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SLC7A2P52569 658 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF460Q14592 562 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GJD3Q8N144 294 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CARFQ8N187 725 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 DTD1Q8TEA8 209 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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