RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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PRPF40A-210ENST00000489741 KLC1Q07866 573 aa6.04□□□□□ -1.44
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PRPF40A-210ENST00000489741 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 BIRC8Q96P09 236 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TREX1Q9NSU2 369 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CTSFQ9UBX1 484 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC23Q9UJX2 597 aa6.04□□□□□ -1.44
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