RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CYP27C1Q4G0S4 372 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TXNDC8Q6A555 127 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TMC8Q8IU68 726 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CIB4A0PJX0 185 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 KCNK5O95279 499 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ALAS2P22557 587 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SPIBQ01892 262 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CACNG1Q06432 222 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 C16orf62Q7Z3J2 963 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D20Q96BZ9 403 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 RAD9AQ99638 391 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 KLHL21Q9UJP4 597 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 YIPF1Q9Y548 306 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 H7C0S8 307 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ZNF250P15622 560 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 HMGCLP35914 325 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MAN2A2P49641 1150 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CYP4F8P98187 520 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF7Q14155 803 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GPR65Q8IYL9 337 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 OR9Q2Q8NGE9 314 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SELENOMQ8WWX9 145 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MYO19Q96H55 970 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ASB8Q9H765 288 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 C12orf10Q9HB07 376 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 NUP50Q9UKX7 468 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SSR3Q9UNL2 185 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.93□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G10O15496 165 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ADRA2AP08913 450 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 NUDT7P0C024 238 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CPN2P22792 545 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 KIR3DL1P43629 444 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CDC42P60953 191 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MAB21L1Q13394 359 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LRRC66Q68CR7 880 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LGI4Q8N135 537 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 DENND6BQ8NEG7 585 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 APOLD1Q96LR9 279 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 EBPLQ9BY08 206 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 B3GNT4Q9C0J1 378 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 NIPAL2Q9H841 368 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 IL26Q9NPH9 171 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MANBAO00462 879 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 BNIP3LO60238 219 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 TNNI3P19429 210 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MAP2K3P46734 347 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CDH18Q13634 790 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 XKRXQ6PP77 449 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CBLL1Q75N03 491 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 FAM124AQ86V42 546 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ALG14Q96F25 216 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 LATS2Q9NRM7 1088 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CLN6Q9NWW5 311 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.92□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GREM1O60565 184 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF15O94989 841 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GSTM1P09488 218 aa12.91□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms