RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MAOAP21397 527 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SAT1P21673 171 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CNTFP26441 200 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HTR1EP28566 365 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SCTRP47872 440 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HSF1Q00613 529 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HYAL2Q12891 473 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ART3Q13508 389 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF460Q14592 562 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MROH9Q5TGP6 573 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SBSNQ6UWP8 590 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NT5CQ8TCD5 201 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GPR137Q96N19 417 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FRMD6Q96NE9 622 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SARGQ9BW04 601 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CENPHQ9H3R5 247 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 VWA7Q9Y334 891 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C19orf84I3L1E1 186 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SP1P08047 785 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 AP1S2P56377 157 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 REEP5Q00765 189 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RBPJQ06330 500 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PWP1Q13610 501 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CSHL1Q14406 222 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MAPKAPK3Q16644 382 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TTMPQ5BVD1 217 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 LGSNQ5TDP6 509 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRABD2AQ86V40 505 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SIAH3Q8IW03 269 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC5A8Q8N695 610 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ELP5Q8TE02 316 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ISL2Q96A47 359 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TLCD1Q96CP7 247 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MTBPQ96DY7 904 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 LRFN1Q9P244 771 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 A0A0G2JN53 185 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPM1 405 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ASPDHA6ND91 283 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 H3BQF6 201 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PRMT3O60678 531 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CD46P15529 392 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KRT15P19012 456 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 IL10P22301 178 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA12P43365 314 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R39P59534 338 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R50P59544 299 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 POU4F1Q01851 419 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RGS1Q08116 209 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ABHD13Q7L211 337 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MAGED4Q96JG8 741 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms