RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.78■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1B0GTH9 108 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 E9PLN8 166 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PEX1O43933 1283 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 HS6ST1O60243 411 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 RAB38P57729 211 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR85P60893 370 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 CD163Q86VB7 1156 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLQ8NG68 377 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 NCLNQ969V3 563 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 VMP1Q96GC9 406 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS39Q96JC1 886 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 QRFPRQ96P65 431 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 CSF3RQ99062 836 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PPT2Q9UMR5 302 aa15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SKIV2L-211ENST00000485349 EML6Q6ZMW3 1958 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFHX3Q15911 3703 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 LRIT2A6NDA9 550 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 31.7
SKIV2L-211ENST00000485349 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 PTGS2P35354 604 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR143P51810 404 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 PLA2G16P53816 162 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC13A2Q13183 592 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TGFBIQ15582 683 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CREG2Q8IUH2 290 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM156Q8N614 296 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 RHOJQ9H4E5 214 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.76■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC13O75165 2243 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 USP27XA6NNY8 438 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 E7ESA3 106 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TAPBPO15533 448 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 B3GALT2O43825 422 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF4O60810 478 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TPOP07202 933 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TFEBP19484 476 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CERS1P27544 350 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 HSD17B7P56937 341 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 KRTAP10-9P60411 292 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 OR2L5Q8NG80 312 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 DERL2Q9GZP9 239 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 WWOXQ9NZC7 414 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 HCFC1P51610 2035 aa15.75■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A0G2JMM0 328 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PPB8 328 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PRS3 328 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CLEC3AO75596 197 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 GSTM2P28161 218 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SSTR2P30874 369 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA7P48741 367 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 SSR4P51571 173 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 LIM2P55344 173 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 EID3Q8N140 333 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT78Q8N1N4 520 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.74■□□□□ 0.11
SKIV2L-211ENST00000485349 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms