RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	KRT6C	P48668	564 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RAB38	P57729	211 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF33B	Q06732	778 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	LY6D	Q14210	128 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CFAP157	Q5JU67	520 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	BRF2	Q9HAW0	419 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	LYRM4	Q9HD34	91 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF225	Q9UK10	706 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	DAPP1	Q9UN19	280 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SPACA6	W5XKT8	324 aa		18.79	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	BLACE	A4D250	179 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PPP6C	O00743	305 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TYROBP	O43914	113 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TRIM13	O60858	407 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	OR4F21	O95013	312 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ESRRB	O95718	433 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	HSD3B1	P14060	373 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TSPAN8	P19075	237 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	HSD3B2	P26439	372 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CERS1	P27544	350 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CCL11	P51671	97 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	NAGLU	P54802	743 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	AP2B1	P63010	937 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RHAG	Q02094	409 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CHAF1B	Q13112	559 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RUNX2	Q13950	521 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TRMO	Q9BU70	441 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	AHSP	Q9NZD4	102 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		18.78	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965		A0A1B0GTL3	188 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CLDN4	O14493	209 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PLPP1	O14494	284 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PRMT3	O60678	531 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAJB6	O75190	326 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SPAG7	O75391	227 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAJB5	O75953	348 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	COX6A1	P12074	109 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ICAM2	P13598	275 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	NEK2	P51955	445 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	LIM2	P55344	173 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PCLAF	Q15004	111 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	HPS6	Q86YV9	775 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	GALNT16	Q8N428	558 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	AGAP11	Q8TF27	550 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	C8orf44	Q96CB5	159 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		18.77	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	HMOX2	P30519	316 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	EFNA3	P52797	238 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	HSD17B7	P56937	341 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	MYBPC3	Q14896	1274 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	NSDHL	Q15738	373 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	RNF175	Q8N4F7	328 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		18.76	■□□□□ 0.59
HDAC10-208	ENST00000470965	METTL6	Q8TCB7	284 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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