RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PARLQ9H300 379 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SNX25Q9H3E2 840 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 FN3KQ9H479 309 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF121Q9H920 327 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 HACD3Q9P035 362 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SCN4AP35499 1836 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa3.23□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ATRXP46100 2492 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 BRCA2P51587 3418 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 URADA6NGE7 173 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 K7EQD1 137 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC1A7O00341 560 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SURF4O15260 269 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 P4HA2O15460 535 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 BCL2L11O43521 198 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 LDHCP07864 332 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 F3P13726 295 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 FOSL2P15408 326 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 AOC1P19801 751 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMA3P25788 255 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPA4P34932 840 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 OR1D5P58170 312 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 CACNG1Q06432 222 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RBBP7Q16576 425 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 PTGISQ16647 500 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 KYNUQ16719 465 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDH1L2Q3SY69 923 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SUSD4Q5VX71 490 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF597Q96LX8 424 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 POLLQ9UGP5 575 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 IL36AQ9UHA7 158 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 USP54Q70EL1 1684 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 LMO7Q8WWI1 1683 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 SLIT3O75094 1523 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 USP47Q96K76 1375 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 EYSQ5T1H1 3165 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PPW3 197 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 CYTIPO60759 359 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 NXPH4O95158 308 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-206ENST00000467748 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 RASA2Q15283 850 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 TOMM20Q15388 145 aa3.21□□□□□ -1.9
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RABGGTB-206ENST00000467748 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 Q6ZR54 194 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC63Q8NA47 563 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA33Q96N06 139 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 CENPOQ9BU64 300 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMA3Q16787 3333 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 IQGAP3Q86VI3 1631 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 ITSN1Q15811 1721 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 NEDD4P46934 1319 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 RNF123Q5XPI4 1314 aa3.2□□□□□ -1.9
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RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2CO00762 179 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 FIBPO43427 364 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 TBX10O75333 385 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 MELTFP08582 738 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC175P0C221 793 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 STAG3L1P0CL83 205 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 EPORP19235 508 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT20P35900 424 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP5CP53041 499 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP12-2P59991 146 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK-16P61578 105 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 SULT2A1Q06520 285 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-206ENST00000467748 DUSP5Q16690 384 aa3.2□□□□□ -1.9
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