RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464313.1

PTPN12-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 4

Gene PTPN12, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-210	ENST00000464313	IYD	Q6PHW0	289 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TMEM99	Q8N816	258 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	EPSTI1	Q96J88	318 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PAK5	Q9P286	719 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ITM2B	Q9Y287	266 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313		E9PQ18	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PI15	O43692	258 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SNAP91	O60641	907 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CRLF1	O75462	422 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CLN5	O75503	358 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	THEGL	P0DJG4	465 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ODC1	P11926	461 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ACKR3	P25106	362 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	OR1D2	P34982	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CLCN4	P51793	760 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	BACE1	P56817	501 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	STX1B	P61266	288 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LY6D	Q14210	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	C3AR1	Q16581	482 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SMU1	Q2TAY7	513 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TMEM64	Q6YI46	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	RNF149	Q8NC42	400 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LGMN	Q99538	433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313		M0R296	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	RNF103	O00237	685 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	P2RX6	O15547	441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ANGPTL1	O95841	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	NUDT17	P0C025	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CD1D	P15813	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	VCL	P18206	1134 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	OXTR	P30559	389 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CTNNB1	P35222	781 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	GCKR	Q14397	625 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LPAL2	Q16609	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	KCNMB4	Q86W47	210 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	FAM131B	Q86XD5	332 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	GGH	Q92820	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	PARL	Q9H300	379 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	KCNK13	Q9HB14	408 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313		A0A1W2PRV1	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	LRRD1	A4D1F6	860 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	ASB14	A6NK59	587 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CHUK	O15111	745 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	TNFSF12	O43508	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	SKIL	P12757	684 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPN12-210	ENST00000464313	CPA3	P15088	417 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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