RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 KIAA0040Q15053 153 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM71Q6P5X7 295 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FIGLAQ6QHK4 219 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FAM180AQ6UWF9 173 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 RNF165Q6ZSG1 346 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 HS2ST1Q7LGA3 356 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TSPAN33Q86UF1 283 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 LYPD6Q86Y78 171 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MKXQ8IYA7 352 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 EID3Q8N140 333 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ESX1Q8N693 406 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FAM46DQ8NEK8 389 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FAM110BQ8TC76 370 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 WFDC5Q8TCV5 224 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 GIPC3Q8TF64 312 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 HDAC7Q8WUI4 952 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 BAALCQ8WXS3 180 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PIGBQ92521 554 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PROX1Q92786 737 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 RAB24Q969Q5 203 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PTERQ96BW5 349 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 EVI5LQ96CN4 794 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 C19orf60Q96EN9 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 HSFY1Q96LI6 401 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 C3orf30Q96M34 536 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ODF3Q96PU9 254 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 GSDMAQ96QA5 445 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PRAM1Q96QH2 718 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF382Q96SR6 550 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ATF6BQ99941 703 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 B3GNT5Q9BYG0 378 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TANGO6Q9C0B7 1094 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FBXL15Q9H469 300 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 C17orf75Q9HAS0 396 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PROK2Q9HC23 129 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TRPC7Q9HCX4 862 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ASNSD1Q9NWL6 643 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SENP1Q9P0U3 644 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PSAT1Q9Y617 370 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MPDZO75970 2070 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NFASCO94856 1347 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZBED9Q6R2W3 1325 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 hDV102S1A0JD36 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KBTBD13C9JR72 458 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 C11orf94C9JXX5 98 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MSH4O15457 936 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RASA4O43374 803 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 IDH3BO43837 385 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RFPL1O75677 317 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GJB3O75712 270 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MTA2O94776 668 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LCA5LO95447 670 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 APBB3O95704 486 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CD8AP01732 235 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HMBSP08397 361 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HOXB7P09629 217 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RPA2P15927 270 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SLC25A16P16260 332 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ERCC3P19447 782 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ENPP1P22413 925 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 BDNFP23560 247 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TNFSF8P32971 234 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GALNSP34059 522 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RPL3P39023 403 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CA7P43166 264 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NRIP1P48552 1158 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 UBE2D1P51668 147 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RPL15P61313 204 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 IL9RQ01113 521 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SATB1Q01826 763 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TLE2Q04725 743 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CDC20Q12834 499 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms