RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRG2O14669 202 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM10O14672 748 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TAPBPO15533 448 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GALT2O43825 422 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX1O43933 1283 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA10O75578 1167 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN14O95500 239 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLCN2P51788 898 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G16P53816 162 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC12A2P55011 1212 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC13A2Q13183 592 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MDGA2Q7Z553 956 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SULF2Q8IWU5 870 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT78Q8N1N4 520 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM156Q8N614 296 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM47BQ8NA70 645 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TTLQ8NG68 377 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NCLNQ969V3 563 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 LURAP1Q96LR2 239 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT12Q99456 494 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 WWOXQ9NZC7 414 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PPT2Q9UMR5 302 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ASB1Q9Y576 335 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 HIVEP1P15822 2718 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A088AWK7 358 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GTH9 108 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 E9PLN8 166 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN4O14493 209 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 HS6ST1O60243 411 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF4O60810 478 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC3AO75596 197 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CERS1P27544 350 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SSTR1P30872 391 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KIR3DL1P43629 444 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPA7P48741 367 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SSR4P51571 173 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 HSD17B7P56937 341 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB38P57729 211 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR85P60893 370 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TERF2Q15554 542 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 XKR6Q5GH73 641 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GPSM1Q86YR5 675 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX31Q8N9S9 440 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ESAMQ96AP7 390 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 VMP1Q96GC9 406 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 QRFPRQ96P65 431 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 F2RL3Q96RI0 385 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CSF3RQ99062 836 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DERL2Q9GZP9 239 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NT5DC2Q9H857 520 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC13O75165 2243 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms