RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RELAQ04206 551 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 FAM53BQ14153 422 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 PCOLCEQ15113 449 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 OR4D1Q15615 310 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 EXT1Q16394 746 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 C3AR1Q16581 482 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MEP1AQ16819 746 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CATSPEREQ5SY80 951 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 PLAG1Q6DJT9 500 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TMEM205Q6UW68 189 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 GPSM1Q86YR5 675 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D19Q8N5T2 526 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MZB1Q8WU39 189 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 OR2A5Q96R48 311 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 OR4K3Q96R72 315 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 VPS11Q9H270 941 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ALG9Q9H6U8 611 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MED4Q9NPJ6 270 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SNX15Q9NRS6 342 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MEMO1Q9Y316 297 aa10.99□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 A8MUI8 341 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 H0YIG0 161 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 I3L1I5 382 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 PRRG2O14669 202 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS4O43181 175 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TFEBP19484 476 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TYK2P29597 1187 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 GDF5P43026 501 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 HSPA7P48741 367 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 AGTR2P50052 363 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 HNMTP50135 292 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R50P59544 299 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-9P60411 292 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CDKL1Q00532 357 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 IRF9Q00978 393 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TLE4Q04727 773 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TESK1Q15569 626 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TGFBIQ15582 683 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 BTBD16Q32M84 506 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ACER2Q5QJU3 275 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ASPGQ86U10 573 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TRABD2AQ86V40 505 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 GHDCQ8N2G8 530 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC5A8Q8N695 610 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SNX31Q8N9S9 440 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 NEIL2Q969S2 332 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TLCD1Q96CP7 247 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 IMMP1LQ96LU5 166 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 NMRAL1Q9HBL8 299 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TINAGQ9UJW2 476 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ZNF835Q9Y2P0 537 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ACOT9Q9Y305 439 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 KCNE2Q9Y6J6 123 aa10.98□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 A0A087X1B8 175 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 E9PLN8 166 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CLGNO14967 610 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 DLG1Q12959 904 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 LGI4Q8N135 537 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 AMER3Q8N944 861 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 ESAMQ96AP7 390 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 NXNL1Q96CM4 212 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-210ENST00000442481 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms