RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 ATP5DP30049 168 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 PKLRP30613 574 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-16P61578 105 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GPR50Q13585 617 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 RAPSNQ13702 412 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 RCN2Q14257 317 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GCKRQ14397 625 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ACKR1Q16570 336 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 TMEM64Q6YI46 380 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 IQCA1Q86XH1 822 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SIAH3Q8IW03 269 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CCDC170Q8IYT3 715 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 RNF149Q8NC42 400 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 VMP1Q96GC9 406 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 UBAC1Q9BSL1 405 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ACPTQ9BZG2 426 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KCNK13Q9HB14 408 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ETV7Q9Y603 341 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 FAM170AA1A519 330 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SERINC4A6NH21 518 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 P2RX6O15547 441 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF749O43361 778 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ANGPTL1O95841 491 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ADORA3P0DMS8 318 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CD1DP15813 335 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ACKR3P25106 362 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CAPGP40121 348 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CLCN4P51793 760 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 BACE1P56817 501 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KRT83P78385 493 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SLC34A1Q06495 639 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 PAX8Q06710 450 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SLC3A1Q07837 685 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CD300CQ08708 224 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF146Q15072 292 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 C3AR1Q16581 482 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 UPP1Q16831 310 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KCTD9Q7L273 389 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ASPGQ86U10 573 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ELMOD1Q8N336 334 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GPR148Q8TDV2 347 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 C2orf40Q9H1Z8 148 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 PANK3Q9H999 370 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KLK13Q9UKR3 277 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SMIM30A4D0T7 59 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 INPP4BO15327 924 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 UROSP10746 265 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SKILP12757 684 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KRT5P13647 590 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 STX1BP61266 288 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 NLRP14Q86W24 1093 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 KCNMB4Q86W47 210 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 NUP93Q8N1F7 819 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 THEM5Q8N1Q8 247 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 Q8N377 158 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF597Q96LX8 424 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 SOSTQ9BQB4 213 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.47□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 FAM149AA5PLN7 773 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 HPRP00739 348 aa3.46□□□□□ -1.86
RBM39-211ENST00000426951 LYNP07948 512 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms