RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP14Q9NWM8 211 aa17.9■□□□□ 0.46
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SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA8P13928 327 aa17.89■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMKMTQ7Z624 323 aa17.89■□□□□ 0.46
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SH3BP1-202ENST00000417536 COL21A1Q96P44 957 aa17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF21O75509 655 aa17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 IER5LQ5T953 404 aa17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF556Q9HAH1 456 aa17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 KBTBD8Q8NFY9 601 aa17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 KCNE2Q9Y6J6 123 aa17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 VIPR1P32241 457 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF763Q0D2J5 394 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 DMC1Q14565 340 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 MED27Q6P2C8 311 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM53Q6P2H8 277 aa17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 IFT52Q9Y366 437 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53BP2Q13625 1128 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD6Q7Z4G1 85 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND6BQ8NEG7 585 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 OR56A3Q8NH54 315 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPRY1Q96DX4 576 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM129BQ96TA1 746 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51B5Q9H339 312 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 HELZP42694 1942 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SNPHO15079 494 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 NPC1O15118 1278 aa17.86■□□□□ 0.45
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