RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF33BQ06732 778 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TEAD4Q15561 434 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 HKDC1Q2TB90 917 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF284Q2VY69 593 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SPANXN2Q5MJ10 180 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SLX4IPQ5VYV7 408 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 IL17RDQ8NFM7 739 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC3BQ96PB8 259 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 EHD3Q9NZN3 535 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SPATA7Q9P0W8 599 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TSPAN6O43657 245 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GSTM1P09488 218 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CISD3P0C7P0 127 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SOX6P35712 828 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 40
FAAP20-206ENST00000414253 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 RLIMQ9NVW2 624 aa23.51■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C5orf42Q9H799 3197 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGEF33A8MVX0 844 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 DNTTP04053 509 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 MMP12P39900 470 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 DGKGP49619 791 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CTSCP53634 463 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 AGAP6Q5VW22 663 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LIPJQ5W064 366 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF367Q7RTV3 350 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC190Q86UF4 302 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NLGN4XQ8N0W4 816 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf65Q8NCR3 313 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 OR4C15Q8NGM1 316 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PIK3R3Q92569 461 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LRIG1Q96JA1 1093 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 AGAP4Q96P64 663 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.5■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CCNKO75909 580 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CRISP3P54108 245 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CYP4F2P78329 520 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 IRF8Q02556 426 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ACSM2AQ08AH3 577 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CAMK1Q14012 370 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ACSM2BQ68CK6 577 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LIPIQ6XZB0 460 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 WDR20Q8TBZ3 569 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GLYATL1Q969I3 302 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 VPS35Q96QK1 796 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 QSOX1O00391 747 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CYP17A1P05093 508 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 HSMCR30P0CW71 290 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CD22P20273 847 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PIK3CBP42338 1070 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 COPZ1P61923 177 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GAB1Q13480 694 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 KCNC3Q14003 757 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GRIN2CQ14957 1233 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C6orf183Q5T699 404 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CPTPQ5TA50 214 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 VPS37AQ8NEZ2 397 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 HCAR2Q8TDS4 363 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 GABRR3A8MPY1 467 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZW10O43264 779 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 UGDHO60701 494 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ELFN1P0C7U0 828 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 VASPP50552 380 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SPIBQ01892 262 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 MICAQ29983 383 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SYTL3Q4VX76 610 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SPATC1Q76KD6 591 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LGI4Q8N135 537 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NAGSQ8N159 534 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CHTF18Q8WVB6 975 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms