RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 ASIC1P78348 528 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 KRT83P78385 493 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CEACAM7Q14002 265 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TEX35Q5T0J7 233 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC47A2Q86VL8 602 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC43A2Q8N370 569 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RNF149Q8NC42 400 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 GDAP1Q8TB36 358 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SPPL2AQ8TCT8 520 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEPT8Q92599 483 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RFT1Q96AA3 541 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ATF6BQ99941 703 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PINK1Q9BXM7 581 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 GNB4Q9HAV0 340 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A0U1RQK1 487 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF320A2RRD8 509 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 INPP4BO15327 924 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ATP9AO75110 1047 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 POP4O95707 220 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 HPRP00739 348 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 IL4RP24394 825 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACKR3P25106 362 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 OXTRP30559 389 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CAPGP40121 348 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAGEB1P43366 347 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PGFP49763 221 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC8A3P57103 927 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC3A1Q07837 685 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CD300CQ08708 224 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 GCKRQ14397 625 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 NFE2L1Q14494 772 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC1A5Q15758 541 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CCDC158Q5M9N0 1113 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 NLRP14Q86W24 1093 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RNF130Q86XS8 419 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RASL10AQ92737 203 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF597Q96LX8 424 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PANX3Q96QZ0 392 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SOSTQ9BQB4 213 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF559Q9BR84 538 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 IDI2Q9BXS1 227 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACPTQ9BZG2 426 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 C2orf40Q9H1Z8 148 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 PNPLA3Q9NST1 481 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CNIH4Q9P003 139 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAGEB16A2A368 324 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM149AA5PLN7 773 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACOD1A6NK06 481 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 M0R296 226 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TTI1O43156 1089 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF749O43361 778 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TGDSO95455 350 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ODC1P11926 461 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACADSP16219 412 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CAPN2P17655 700 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 MUTP22033 750 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 GJB2P29033 226 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR1D2P34982 312 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ATP4BP51164 291 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SRPXP78539 464 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 COX10Q12887 443 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLMAPQ14BN4 828 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACKR1Q16570 336 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 C3AR1Q16581 482 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 LRRC38Q5VT99 294 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 KCNMB4Q86W47 210 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 LMNTD2Q8IXW0 634 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-179P-201ENST00000363350 CLYBLQ8N0X4 340 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms