RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOLH1Q04609 750 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CETN1Q12798 172 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFCP2Q12800 502 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABRQ12979 859 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121L1PQ3SYA9 428 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNLSQ5VYX0 342 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LEMD1Q68G75 181 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMBQ6PCB8 327 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 VITQ6UXI7 678 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL23Q86XA0 190 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELMOD1Q8N336 334 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC43A2Q8N370 569 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM99Q8N816 258 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMYD1Q8NB12 490 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD99L2Q8TCZ2 262 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMPDL3AQ92484 453 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERO1AQ96HE7 468 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARCH7Q9H992 704 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CROCCQ5TZA2 2017 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ILVBLA1L0T0 632 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLLNB2CW77 178 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 E9PAM4 449 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANHXE9PGG2 379 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSL4O60488 711 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAP2O75791 330 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF19O95750 216 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC1A4P43007 532 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPBWR1P48145 328 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBBP4Q09028 425 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX35Q5T0J7 233 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PET117Q6UWS5 81 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDHQ8IZJ6 230 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BANPQ8N9N5 519 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP11Q8TF27 550 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPHQ8WWY8 451 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM7Q9C029 511 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMUR1Q9HB89 426 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TERF2IPQ9NYB0 399 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 THYN1Q9P016 225 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3GLB1Q9Y371 365 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLON5A6NGN9 336 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 YDJCA8MPS7 323 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD13C9JR72 458 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBP2O00757 339 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GAT1O43505 415 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM44O43615 452 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RLN1P04808 185 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOAT1P35610 550 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 MATKP42679 507 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCN1BQ07699 218 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPK1Q13572 414 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM7Q14002 265 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 C3AR1Q16581 482 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM44Q2T9K0 475 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF212Q495C1 297 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASC4Q6P4E1 433 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD46Q86W74 232 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC49Q8IUZ0 686 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF149Q8NC42 400 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1524Q8TCG1 905 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNASE1L2Q92874 299 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35C1Q96A29 364 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD27Q96NW4 1050 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCHY1Q96PM5 261 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG101Q9BSB4 218 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDEM3Q9BZQ6 932 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A14Q9HCY8 104 aa2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms