RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 RCVRNP35243 200 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PGS1Q32NB8 556 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SPATS1Q496A3 300 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PRRT3Q5FWE3 981 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 FBXL6Q8N531 539 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PATE1Q8WXA2 126 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 MS4A8Q9BY19 250 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 TRIM64BA6NI03 449 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 BTN3A3O00478 584 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SCN2BO60939 215 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CLPXO76031 633 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CYP4F2P78329 520 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 38.6
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ABCD4-201ENST00000356924 GTDC1Q4AE62 458 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CADM4Q8NFZ8 388 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 LCN9Q8WX39 176 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PSD2Q9BQI7 771 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 INPP5KQ9BT40 448 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 USP22Q9UPT9 525 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 STK25O00506 426 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 YY2O15391 372 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KRT75O95678 551 aa10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KCNH6Q9H252 994 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SIAEQ9HAT2 523 aa10.6□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 OR6C2Q9NZP2 312 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 IFT52Q9Y366 437 aa10.6□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TRBC2A0A5B9 178 aa10.59□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 OR1F1O43749 312 aa10.59□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 ATP6V1B2P21281 511 aa10.59□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 SLC7A1P30825 629 aa10.59□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 C16orf78Q8WTQ4 265 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF347Q96SE7 839 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
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ABCD4-201ENST00000356924 SYNPO2LQ9H987 977 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 MUTYHQ9UIF7 546 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.59□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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