RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 CLDND1Q9NY35 253 aa15.52■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PP18 115 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 C11orf98E9PRG8 122 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DEFB119Q8N690 84 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KCNN1Q92952 543 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OTUB2Q96DC9 234 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KCTD3Q9Y597 815 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GTF2F2P13984 249 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TYRP1P17643 537 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CCDC58Q4VC31 144 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KLHL15Q96M94 604 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SIX2Q9NPC8 291 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FZD3Q9NPG1 666 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 B8ZZF3 427 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 KCNQ1P51787 676 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EPGNQ6UW88 154 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MCHR1Q99705 422 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OLIG2Q13516 323 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 COMTD1Q86VU5 262 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ABCB7O75027 752 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLITRK5O94991 958 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PET100P0DJ07 73 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GPM6BQ13491 265 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TRAM2Q15035 370 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MOGQ16653 247 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FHP07954 510 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GSTM2P28161 218 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GAS6Q14393 721 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DNAAF1Q8NEP3 725 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PHOX2BQ99453 314 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 FZD8Q9H461 694 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PLD2O14939 933 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF773Q6PK81 442 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GATSQ8NAP1 163 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RAD51DO75771 328 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CLIC3O95833 236 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PDYNP01213 254 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 EBLN1P0CF75 366 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ZNF35P13682 527 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 S1PR1P21453 382 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 GNMTQ14749 295 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 INAVAQ3KP66 663 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 A0A1W2PPW3 197 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 H7C417 338 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SLC19A2O60779 497 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 SELENOVP59797 346 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 PLP2Q04941 152 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 NIPAL1Q6NVV3 410 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.5■□□□□ 0.07
RXRA-201ENST00000356384 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms