RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PTOV1Q86YD1 416 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C10orf111Q8N326 155 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 NETO1Q8TDF5 533 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PYURFQ96I23 114 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 URADA6NGE7 173 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PDPK1O15530 556 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SERPINA1P01009 418 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SERPIND1P05546 499 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 UGT2B7P16662 529 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 JUNDP17535 347 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 KDELR2P33947 212 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PCGF2P35227 344 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 GAB1Q13480 694 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ELOCQ15369 112 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MANEAQ5SRI9 462 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ASPGQ86U10 573 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 NAGSQ8N159 534 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FRMD1Q8N878 549 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PJA1Q8NG27 643 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC37A2Q8TED4 501 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SPACA7Q96KW9 195 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CIB1Q99828 191 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 AICDAQ9GZX7 198 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 UCK1Q9HA47 277 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR6C74A6NCV1 312 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TPST1O60507 370 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 PRKD3O94806 890 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 RASAL1O95294 804 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 MVDP53602 400 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 PLA2G16P53816 162 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 BIRC2Q13490 618 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 MYBPC3Q14896 1274 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 SPESP1Q6UW49 350 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 Q7L0L9 218 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FBXO30Q8TB52 745 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FAM110BQ8TC76 370 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 RSC1A1Q92681 617 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC29A1Q99808 456 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 NLNQ9BYT8 704 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 KLHL31Q9H511 634 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TLR4O00206 839 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 TNFRSF21O75509 655 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 CKMT2P17540 419 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 MAGEA2P43356 314 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 CBLL1Q75N03 491 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 GKN2Q86XP6 184 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-202ENST00000338546 OR2A5Q96R48 311 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms