RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 CDH23Q9H251 3354 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PPV9 198 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GABARAPO95166 117 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP2K4P45985 399 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GPM6BQ13491 265 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PROX2Q3B8N5 592 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKDD1AQ495B1 522 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 VITQ6UXI7 678 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CXorf36Q9H7Y0 433 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SLAMF7Q9NQ25 335 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DOCK8Q8NF50 2099 aa19.82■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SH3PXD2BA1X283 911 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFRSF11BO00300 401 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MAN1A2O60476 641 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMB5P28074 263 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 OR1E2P47887 323 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 REEP5Q00765 189 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DUSP6Q16828 381 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DEPDC1Q5TB30 811 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD11Q8NFV4 315 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GIPC3Q8TF64 312 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF347Q96SE7 839 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD21L1Q9H4I0 556 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SFXN1Q9H9B4 322 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SCN3BQ9NY72 215 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RTCAO00442 366 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RECKO95980 971 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CA3P07451 260 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GJA4P35212 333 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SOAT1P35610 550 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BSGP35613 385 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MOGQ16653 247 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10G2Q8NGC3 310 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FEVQ99581 238 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MIEF1Q9NQG6 463 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DGKBQ9Y6T7 804 aa19.81■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TBX19O60806 448 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT75O95678 551 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DDCP20711 480 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 NR4A1P22736 598 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP4F2P78329 520 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB46Q86UZ6 589 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CACUL1Q86Y37 369 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BORCS5Q969J3 196 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 YIPF6Q96EC8 236 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 AIF1LQ9BQI0 150 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 LHX9Q9NQ69 397 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RLIMQ9NVW2 624 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA7Q9P0W8 599 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MID1O15344 667 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF10O60809 474 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM20BO75063 409 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CLPXO76031 633 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 UQCRC2P22695 453 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PRIM2P49643 509 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SPIBQ01892 262 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM180BQ6P0A1 224 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF605Q86T29 641 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC5A8Q8N695 610 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM81AQ8TBF8 368 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 LZICQ8WZA0 190 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RORBQ92753 470 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TM4SF18Q96CE8 201 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNC2Q96PR1 638 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 F2RL3Q96RI0 385 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL7BQ9BQE9 202 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX101Q9BY14 249 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RASSF1Q9NS23 344 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 AHSPQ9NZD4 102 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF6Q9Y252 685 aa19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RGS10O43665 173 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 KAT7O95251 611 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 HSD17B2P37059 387 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 XCR1P46094 333 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 LIMS1P48059 325 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BMXP51813 675 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RUNX3Q13761 415 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR153Q6NV75 609 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PRSS48Q7RTY5 328 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF540Q8NDQ6 660 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 DNASE1L2Q92874 299 aa19.79■□□□□ 0.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCG4Q9H172 646 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms