RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TLCD2A6NGC4 264 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP33O14559 1287 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 DDCP20711 480 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 GSTM5P46439 218 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SLAMF1Q13291 335 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SMIM10Q96HG1 83 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SIGLEC6O43699 453 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CER1O95813 267 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ALDH9A1P49189 494 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 BTN3A2P78410 334 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CFHR1Q03591 330 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SLC9A5Q14940 896 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 AMZ1Q400G9 498 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 OR8J3Q8NGG0 315 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CCDC115Q96NT0 180 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 PANX1Q96RD7 426 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 KLHL3Q9UH77 587 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 BTNL2Q9UIR0 455 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ASB4Q9Y574 426 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SCN2AQ99250 2005 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CASC3O15234 703 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 DUX1O43812 170 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SCELO95171 688 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ANP32DO95626 131 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 HSD17B1P14061 328 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TRPC1P48995 793 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CCNIQ14094 377 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 UCN3Q969E3 161 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ASB9Q96DX5 294 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TCTN2Q96GX1 697 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 U3KQA8 63 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 SPTBP11277 2137 aa22.61■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 URADA6NGE7 173 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ACOT8O14734 319 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CTSBP07858 339 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 GSK3BP49841 420 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 GPLD1P80108 840 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 LIPEQ05469 1076 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 NR0B2Q15466 257 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 HIPK4Q8NE63 616 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 GBP5Q96PP8 586 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ALG2Q9H553 416 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 STARD5Q9NSY2 213 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 C5AR2Q9P296 337 aa22.6■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 TBX19O60806 448 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 C9P02748 559 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CSF2RBP32927 897 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 MPLP40238 635 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 FLOT2Q14254 428 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 EID2Q8N6I1 236 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 FAM47BQ8NA70 645 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CD180Q99467 661 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.59■■□□□ 1.21
TMIE-201ENST00000326431 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms