RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 K7ENP7 123 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 AZIN1O14977 448 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS11DO60235 418 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 RECKO95980 971 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KRT6AP02538 564 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 ALBP02768 609 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KRT6BP04259 564 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 FGF4P08620 206 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 NEFHP12036 1026 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB1P30740 379 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SSR2P43308 183 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SLC1A6P48664 564 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KRT6CP48668 564 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 RAP1GDS1P52306 607 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MTTPP55157 894 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PPP2R2AP63151 447 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CXADRP78310 365 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CUL3Q13618 768 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KANK2Q63ZY3 851 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CA13Q8N1Q1 262 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 OR2T11Q8NH01 316 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 UCN3Q969E3 161 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 RGMAQ96B86 450 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MIEF2Q96C03 454 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 APIPQ96GX9 242 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 LANCL2Q9NS86 450 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KCND3Q9UK17 655 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PPT2Q9UMR5 302 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MED13Q9UHV7 2174 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 IDSB3KWA1 339 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 B4GALT2O60909 372 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CRCPO75575 148 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 HSPA4LO95757 839 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 KLK1P06870 262 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00032P0C843 101 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 UROSP10746 265 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 OTX2P32243 289 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 LIM2P55344 173 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 NAA20P61599 178 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 BTG2P78543 158 aa8.58□□□□□ -1.04
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PDE4D-201ENST00000309641 STX3Q13277 289 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZSR9 355 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MMP21Q8N119 569 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 FAM47BQ8NA70 645 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 C8orf44Q96CB5 159 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 C3orf30Q96M34 536 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SERINC2Q96SA4 455 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINI1Q99574 410 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 WDR54Q9H977 334 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 BRF2Q9HAW0 419 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 DAPP1Q9UN19 280 aa8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0A6YYD5 115 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 CYR61O00622 381 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PIP5K1BO14986 540 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 B3GALT2O43825 422 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 ALOX12BO75342 701 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SCELO95171 688 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 NR1D1P20393 614 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 FOLR3P41439 243 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 PHEXP78562 749 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 VAC14Q08AM6 782 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 SLAMF1Q13291 335 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.57□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 BROXQ5VW32 411 aa8.57□□□□□ -1.04
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