RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 SETD9Q8NE22 299 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 COQ8BQ96D53 544 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 YIPF6Q96EC8 236 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 DTD2Q96FN9 168 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ZNF347Q96SE7 839 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CTRCQ99895 268 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 APOL4Q9BPW4 351 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LGR4Q9BXB1 951 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 REEP4Q9H6H4 257 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SCN3BQ9NY72 215 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ASF1AQ9Y294 204 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 NDUFB5O43674 189 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 UGDHO60701 494 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TIMP1P01033 207 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 STSP08842 583 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 FURINP09958 794 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 BMP4P12644 408 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 POU1F1P28069 291 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 WASP42768 502 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SELENOWP63302 87 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ERAP2Q6P179 960 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TTC23LQ6PF05 361 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ATL1Q8WXF7 558 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PPCDCQ96CD2 204 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 BTBD2Q9BX70 525 aa9.45□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 KDM1AO60341 852 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TNFRSF21O75509 655 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CISD3P0C7P0 127 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 HSMCR30P0CW71 290 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 JUNDP17535 347 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TGFBR2P37173 567 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 KCNC3Q14003 757 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CAMK1Q14012 370 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 VEZF1Q14119 521 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SPIN4Q56A73 249 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LGI4Q8N135 537 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 AMER3Q8N944 861 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ZNF566Q969W8 418 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 F2RL3Q96RI0 385 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 COPS4Q9BT78 406 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 BRF2Q9HAW0 419 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 MYO9BQ13459 2157 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SERTM1A2A2V5 107 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PRMT3O60678 531 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ADH5P11766 374 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PCGF2P35227 344 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ASMTP46597 345 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 IL18R1Q13478 541 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ZNF846Q147U1 533 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 KCNJ8Q15842 424 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 PAGE2Q7Z2X7 111 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SZRD1Q7Z422 152 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 ADCK1Q86TW2 530 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 P3H2Q8IVL5 708 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 CADM3Q8N126 398 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 KLK6Q92876 244 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 LGALS12Q96DT0 336 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 NUS1Q96E22 293 aa9.44□□□□□ -0.9
LIPC-201ENST00000299022 COQ10AQ96MF6 247 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms