RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 OR4D2P58180 307 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 HERVK_113P63132 956 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 BTG2P78543 158 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 NADK2Q4G0N4 442 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SFT2D3Q587I9 215 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 TM9SF4Q92544 642 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 NTMT1Q9BV86 223 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 ERVK-6Q9BXR3 956 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 PRDM7Q9NQW5 492 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa23.65■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SUPT7LO94864 414 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 OTCP00480 354 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SERPINA7P05543 415 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CELA2AP08217 269 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ICAM2P13598 275 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MAOAP21397 527 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CCT5P48643 541 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 NEK2P51955 445 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RPS13P62277 151 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TRAF3Q13114 568 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 QSOX2Q6ZRP7 698 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 FAM47BQ8NA70 645 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 COPEO14579 308 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 KRT4P19013 534 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 LIM2P55344 173 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 AP2B1P63010 937 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RCN2Q14257 317 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 BTBD16Q32M84 506 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ZNF793Q6ZN11 406 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TRPC4APQ8TEL6 797 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RGMAQ96B86 450 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TMEM237Q96Q45 408 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SCN2AQ99250 2005 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 LPAR4Q99677 370 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TRIM4Q9C037 500 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 EPN3Q9H201 632 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 DAPP1Q9UN19 280 aa23.63■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CLDN4O14493 209 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MYL2P10916 166 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CLCQ05315 142 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 UNC50Q53HI1 259 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 OR4C11Q6IEV9 310 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 LINC00696Q6ZRV3 163 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SIRT6Q8N6T7 355 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CCDC63Q8NA47 563 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 WDR20Q8TBZ3 569 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 EPS8L2Q9H6S3 715 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PTGFRNQ9P2B2 879 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 EMCNQ9ULC0 261 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SPACA6W5XKT8 324 aa23.62■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PPP6CO00743 305 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ITGAMP11215 1152 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 IMPDH1P20839 514 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 PRKAA2P54646 552 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 TLE1Q04724 770 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 IFT88Q13099 833 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SLC13A2Q13183 592 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CCDC153Q494R4 210 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 GGTA1PQ4G0N0 100 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 SGO1Q5FBB7 561 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 FRG2Q64ET8 278 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 ISLR2Q6UXK2 745 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 AMER2Q8N7J2 671 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 FRG2BQ96QU4 278 aa23.61■■□□□ 1.37
PDF-201ENST00000288022 CSF3RQ99062 836 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms