RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 CHST10O43529 356 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CORO7P57737 925 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GUCY2DQ02846 1103 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 WLSQ5T9L3 541 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CHSY3Q70JA7 882 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 OR2M7Q8NG81 312 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ASB11Q8WXH4 323 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CCDC138Q96M89 665 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CCDC77Q9BR77 488 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 HPF1Q9NWY4 346 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KCMF1Q9P0J7 381 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CBLCQ9ULV8 474 aa11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 VPS13CQ709C8 3753 aa11.15□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MPDZO75970 2070 aa11.15□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ATRQ13535 2644 aa11.15□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GVC2 190 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 A8MUA0 341 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ARHGEF9O43307 516 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 SUSD5O60279 629 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 FTCDO95954 541 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 IGHG3P01860 377 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 GABRA1P14867 456 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ADH7P40394 386 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 KCNJ11Q14654 390 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 RTL6Q6ICC9 239 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 GK5Q6ZS86 529 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 C17orf64Q86WR6 236 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 LPGAT1Q92604 370 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ALG3Q92685 438 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 SARAFQ96BY9 339 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ZIM3Q96PE6 472 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 KRT12Q99456 494 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 TREX1Q9NSU2 369 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 DEPPQ9NTK1 212 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 HIVEP2P31629 2446 aa11.15□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 HSPB2A8KAH6 182 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 GFYI3L273 518 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 AQP7O14520 342 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 RAD51CO43502 376 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 VAPBO95292 243 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 LY6G6DO95868 133 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 IFNB1P01574 187 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 APRTP07741 180 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 MYZAPP0CAP1 466 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 ALOX12P18054 663 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 MAOAP21397 527 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 IMPA1P29218 277 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 CXCR5P32302 372 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 MAN2A2P49641 1150 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 BTG2P78543 158 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 HSPB2Q16082 182 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 DEFB134Q4QY38 66 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 TRILQ7L0X0 811 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 MAIP1Q8WWC4 291 aa11.14□□□□□ -0.63
SPC25-201ENST00000282074 SLCO2A1Q92959 643 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms