RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3GL1-201ENST00000269886 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3GL1-201ENST00000269886 ARAFP10398 606 aa22.97■■□□□ 1.27
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