RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
COPS4-201ENST00000264389 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.9□□□□□ -1.14
COPS4-201ENST00000264389 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.9□□□□□ -1.14
COPS4-201ENST00000264389 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 EVPLLA8MZ36 301 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PDPK1O15530 556 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 P2RX6O15547 441 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GUCY1B2O75343 617 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ST6GAL1P15907 406 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CERS1P27544 350 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 HTR1EP28566 365 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PTPN6P29350 595 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SOX11P35716 441 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 EPHA4P54764 986 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OR4D2P58180 307 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 RAB8AP61006 207 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 RELAQ04206 551 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MAP7Q14244 749 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SLC9A5Q14940 896 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 MMP21Q8N119 569 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OR8K5Q8NH50 307 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OR10A6Q8NH74 314 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PIGKQ92643 395 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 OR2A5Q96R48 311 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ABCG4Q9H172 646 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PIF1Q9H611 641 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 AQP12BA6NM10 295 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GSTA4O15217 222 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TBX19O60806 448 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GPR37L1O60883 481 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GMNNO75496 209 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 C6orf47O95873 294 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 NCK1P16333 377 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SOAT1P35610 550 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 RXRGP48443 463 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 BNC1Q01954 994 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 RHDQ02161 417 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 BNIP3Q12983 259 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SLAMF1Q13291 335 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 GAB1Q13480 694 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 CYP51A1Q16850 503 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ABHD13Q7L211 337 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PROSER1Q86XN7 944 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 NATD1Q8N6N6 113 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 AMER3Q8N944 861 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FAM47BQ8NA70 645 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 KCT2Q8NC54 265 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 NLNQ9BYT8 704 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 IL21RQ9HBE5 538 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.89□□□□□ -1.15
COPS4-201ENST00000264389 USP22Q9UPT9 525 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.8 ms