RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 LINGO2Q7L985 606 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 C12orf40Q86WS4 652 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 NRROSQ86YC3 692 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MCHR1Q99705 422 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MALT1Q9UDY8 824 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ABCB7O75027 752 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 KAT7O95251 611 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 RAB2AP61019 212 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SH3BP2P78314 561 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MC1RQ01726 317 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 CD47Q08722 323 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MAPK14Q16539 360 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SGCBQ16585 318 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF773Q6PK81 442 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 BBS10Q8TAM1 723 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 USP3Q9Y6I4 520 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf74A8MZ97 194 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 DFNA5O60443 496 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ENTPD6O75354 484 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GRIA2P42262 883 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 DHCR24Q15392 516 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM156Q8N614 296 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR52B6Q8NGF0 335 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OSTF1Q92882 214 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 CST11Q9H112 138 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 A0A0U1RQS6 177 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1W2PP55 124 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PDYNP01213 254 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF20P17024 532 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SLC6A6P31641 620 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 KDELR2P33947 212 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 KDELC1Q6UW63 502 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GHDCQ8N2G8 530 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR2L5Q8NG80 312 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 FIBINQ8TAL6 211 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 NKD1Q969G9 470 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 IFT52Q9Y366 437 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PRAMEF10O60809 474 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 CLIC3O95833 236 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 CH25HO95992 272 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GP1BBP13224 206 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 IFI30P13284 250 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR3A3P47888 321 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR3A2P47893 321 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 DOC2AQ14183 400 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 FAM189A2Q15884 450 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 LIPT1Q9Y234 373 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 H0YAE9 185 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 H3BSA7 217 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SPINT3P49223 89 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 OR12D2P58182 307 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 HYAL2Q12891 473 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 BNIP3Q12983 259 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 ATP6AP1Q15904 470 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 MEP1AQ16819 746 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PHF19Q5T6S3 580 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 HSDL2Q6YN16 418 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM203Q969S6 136 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 TAMM41Q96BW9 452 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SCRN2Q96FV2 425 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SLC22A4Q9H015 551 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 XKR8Q9H6D3 395 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 SEC14L4Q9UDX3 406 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRS-201ENST00000262963 GLOD5A6NK44 160 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms