RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 LIM2P55344 173 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TAP2Q03519 686 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SEC23BQ15437 767 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SPATS1Q496A3 300 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MED27Q6P2C8 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ELMOD1Q8N336 334 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ARRDC3Q96B67 414 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PPCDCQ96CD2 204 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DACH2Q96NX9 599 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DOHHQ9BU89 302 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRBC2A0A5B9 178 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 M0R3H8 397 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FFAR1O14842 300 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 FKTNO75072 461 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SERPINB7O75635 380 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GABARAPO95166 117 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CBSLP0DN79 551 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ALOX12P18054 663 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TNNI3P19429 210 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CNR2P34972 360 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CBSP35520 551 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MAP4K2Q12851 820 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 STX19Q8N4C7 294 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 DTX3Q8N9I9 347 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 EQTNQ9NQ60 294 aa8.29□□□□□ -1.08
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GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PRB8 838 aa8.28□□□□□ -1.08
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GINS1-201ENST00000262460 OR2A25A4D2G3 310 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 H3BN98 237 aa8.28□□□□□ -1.08
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GINS1-201ENST00000262460 CCDC159P0C7I6 412 aa8.28□□□□□ -1.08
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GINS1-201ENST00000262460 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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GINS1-201ENST00000262460 POF1BQ8WVV4 589 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 ZNF347Q96SE7 839 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 CHST8Q9H2A9 424 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS1-201ENST00000262460 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.28□□□□□ -1.08
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