RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 DAPP1Q9UN19 280 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.99■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CYR61O00622 381 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PLPP1O14494 284 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT2O60909 372 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ACPPP15309 386 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NR1D1P20393 614 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NAGLUP54802 743 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 LIM2P55344 173 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 BTG2P78543 158 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PCLAFQ15004 111 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TSLPQ969D9 159 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NUDT9Q9BW91 350 aa20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 A6NL46 340 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PCDH17O14917 1159 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT2O43825 422 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 HPP00738 406 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SFTPCP11686 197 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RAB38P57729 211 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 LCP2Q13094 533 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CUL3Q13618 768 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 GALNT16Q8N428 558 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MLYCDO95822 493 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 PDYNP01213 254 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 BSGP35613 385 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ARFIP1P53367 373 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TGM3Q08188 693 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF843Q8N446 348 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 AGAP11Q8TF27 550 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 RGMAQ96B86 450 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 SMC6Q96SB8 1091 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 CSF3RQ99062 836 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.96■□□□□ 0.95
SYF2-201ENST00000236273 A0A088AWK7 358 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ERLIN1O75477 346 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ETV4P43268 484 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 LIPMQ5VYY2 423 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CCDC63Q8NA47 563 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PGM2Q96G03 612 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms