RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6337K7N6X9 211 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3115L7N285 211 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7030Q0WXH6 285 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scrn3Q3TMH2 418 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VclQ64727 1066 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cr1lQ64735 483 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RorbQ8R1B8 470 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1276Q8VF40 312 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr866Q8VFI7 312 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prdm9Q96EQ9 843 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AassQ99K67 926 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mgat4dQ9D4R2 373 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Elf4Q9Z2U4 655 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smok4aA0JLX3 433 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp472B0V2W5 534 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mterf1bB9EJ57 379 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pbx2O35984 430 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CatP24270 527 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timp2P25785 220 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Htr1bP28334 386 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cds1P98191 461 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GiprQ0P543 460 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem38aQ3TMP8 298 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ephx3Q3V1F8 367 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xkr9Q5GH62 373 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Egfl8Q6GUQ1 293 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PapolgQ6PCL9 739 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr594Q7TRR4 311 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dlgap2Q8BJ42 1059 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bpifb2Q8C1E1 462 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr26Q8C6G8 641 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccm2Q8K2Y9 453 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam161aQ8QZV6 448 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfyve21Q8VCM3 234 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr447Q8VGP6 310 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dll4Q9JI71 686 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adam23Q9R1V7 829 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhbdl2A2AGA4 302 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt83E9Q1Y9 479 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm17615E9Q9P2 165 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r12L7N217 831 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r92L7N2A4 860 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EllO08856 602 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psmc3ipO35047 217 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tssk2O54863 358 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rgs14P97492 547 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grin2cQ01098 1239 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-M3Q31093 336 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10696Q3UTC4 357 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm906Q3V0M1 1017 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh16a1Q571I9 802 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam20cQ5MJS3 579 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gramd2bQ6PEM6 445 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc39a9Q8BFU1 308 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbxl4Q8BH70 621 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spon2Q8BMS2 330 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bend7Q8BSV3 434 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ExogQ8C163 368 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BtdQ8CIF4 520 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snrnp27Q8K194 155 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chaf1bQ9D0N7 572 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpinb1aQ9D154 379 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aar2Q9D2V5 384 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Psmg2Q9EST4 264 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ItgaxQ9QXH4 1169 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trav1A0A075B5Z4 110 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6811E9Q3Y8 510 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cldn4O35054 210 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GfapP03995 430 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnj12P52187 427 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dbx1P52950 335 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 InhbcP55104 352 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gal3st3P61315 431 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ica1P97411 478 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igfbp5Q07079 271 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col19a1Q0VF58 1136 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcna7Q17ST2 489 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr681Q3SXH8 315 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RogdiQ3TDK6 287 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Parp8Q3UD82 852 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Defb48Q3UW22 87 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11492Q5ND19 536 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Osbp2Q5QNQ6 908 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PianpQ6P1B3 278 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ckmt2Q6P8J7 419 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mvb12aQ78HU3 271 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PeloQ80X73 385 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 E330021D16RikQ8BW45 371 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc38a4Q8R1S9 547 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd207Q8VBX4 331 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr353Q8VGK0 311 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.4 ms