RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 LRIT2A6NDA9 550 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 GABRR3A8MPY1 467 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MLYCDO95822 493 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CD46P15529 392 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CRABP2P29373 138 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HSPA7P48741 367 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 BTG2P78543 158 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 LAPTM5Q13571 262 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RCN2Q14257 317 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 OR4D1Q15615 310 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 OR1C1Q15619 314 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 PDK4Q16654 411 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RAPH1Q70E73 1250 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SNX31Q8N9S9 440 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MDS2Q8NDY4 140 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR34Q96EX3 536 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 NPAS2Q99743 824 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 AICDAQ9GZX7 198 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 C4orf51C9J302 202 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CLDN4O14493 209 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 B3GALT2O43825 422 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CLDN1O95832 211 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MAOAP21397 527 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CD96P40200 585 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNK10P57789 538 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RBPJQ06330 500 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TGM3Q08188 693 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SLMAPQ14BN4 828 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TERF2Q15554 542 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 XKR6Q5GH73 641 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2L5Q8NG80 312 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 FBF1Q8TES7 1133 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RELTQ969Z4 430 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SCMH1Q96GD3 660 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC189A1A4V9 331 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM227AF5H4B4 570 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 UNC5CO95185 931 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MST1P26927 711 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CASP2P42575 452 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 HSD17B7P56937 341 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB38P57729 211 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 IRF8Q02556 426 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 RUNX2Q13950 521 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 DOC2AQ14183 400 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TBCCQ15814 346 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 UBE2E3Q969T4 207 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SERINC2Q96SA4 455 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CD244Q9BZW8 370 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ALG9Q9H6U8 611 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 LRFN1Q9P244 771 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CENPEQ02224 2701 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 ASPDHA6ND91 283 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 FCHO1O14526 889 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 MAN1A2O60476 641 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 KERAO60938 352 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRVP-204ENST00000639439 TFEBP19484 476 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms