RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 PNCKQ6P2M8 343 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMEM203Q969S6 136 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CDH7Q9ULB5 785 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ARID1AO14497 2285 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PS29 197 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NPIPA8P0DM63 369 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PGDP52209 483 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PPP2CBP62714 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PPP2CAP67775 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ERV3-1Q14264 604 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GPR68Q15743 365 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CDKN3Q16667 212 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMEM107Q6UX40 140 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 DPPA4Q7L190 304 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GPR65Q8IYL9 337 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 OR2T29Q8NH02 315 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CLMPQ9H6B4 373 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SDK2Q58EX2 2172 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NOTCH4Q99466 2003 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TRBC2A0A5B9 178 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 QSOX1O00391 747 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MAGEB3O15480 346 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FGF19O95750 216 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 EGFP01133 1207 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 IFNA16P05015 189 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 C8BP07358 591 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CERS1P27544 350 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HTR1EP28566 365 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PRLHRP49683 370 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKP4-217ENST00000628904 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FATE1Q969F0 183 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HHIPQ96QV1 700 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FEVQ99581 238 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 KCNH6Q9H252 994 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 KLHL31Q9H511 634 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RDH14Q9HBH5 336 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FGF22Q9HCT0 170 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 OLAHQ9NV23 265 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MKLN1Q9UL63 735 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMCO1Q9UM00 188 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 M0R3H8 397 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 INMTO95050 263 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 BCL10O95999 233 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.261e-9■□□□□ 9.8
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PKP4-217ENST00000628904 NT5EP21589 574 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ITGB7P26010 798 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 DCTP40126 519 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ATP4BP51164 291 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CCR8P51685 355 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CD47Q08722 323 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLAMF1Q13291 335 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TTC23Q5W5X9 447 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 USP53Q70EK8 1073 aa7.18□□□□□ -1.26
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